навряд ли,хотя кто его знает,библиотека проста, читает,пишет прямо в регистры процессора,wiringPi может работать с прерываниями,это более правильный подход,может быть нагрузку создает интерпретатор ,попробуйте запустить код на си посмотрит,попробуйте в интерпретаторе только опрашивать порты,посмотрите что изменилось.